Andre Hosper

Joined: Jul 8, 2013 Last Active: Mar 18, 2024 iNaturalist

Lid sinds 2013 dus al bijna 10 jaar!!
(I forgot that people/6675 was already one full year earlier in those days iNat grew with 10k a year)
https://entogem.github.io/
https://www.herenboeren.nl/webinars/
https://www.youtube.com/channel/UC13MLK1kAgP1eJByIjbwfbg

1. Wiki Uploader

This app has a nice workflow for uploading photos https://www.wikiuploaderapp.com/features.html
https://download.cnet.com/Wiki-Uploader/3000-20418_4-78600545.html
Although this app is not in "React" i thought the sourcecode was open..Sourcecode https://github.com/lyrk/Commons and it prevents double uploading.
Step1..Select the photos to upload
Step2. Add info in some fields
Step 3. Upload the files
Step 4. Gray out, Green circle around the photos
https://github.com/joergmlpts/nature-id
https://apps.apple.com/us/app/wiki-uploader/id1271265731

https://global.discourse-cdn.com/business6/uploads/inaturalist/optimized/3X/5/1/516295e18a7dff539b63fb4bb026fa5e460076ac_2_281x499.jpeg
https://apps.apple.com/us/app/wiki-uploader/id1271265731

2. Forum wrn.nl over Inaturalist

iNaturalist heeft dan wel weer een aantal voordelen die zo evident zijn. Anderen noemden drie zaken:
2.1) Meer buitenlandse specialisten. Dat kan altijd veranderen, maar momenteel kan je voor heel wat groepen in bepaalde werelddelen enkel terecht op iNaturalist.
2.2) De mogelijkheden van de 'batch editing'. Zeer handige tool in iNaturalist.
2.3) Vooral voor fotografen die bijvoorbeeld een gestructureerde foto-database hebben met tags en keywords, waar alles al is gedetermineerd. Automatisch inladen van veel gegevens, waaronder wetenschappelijk naam samen met alle andere EXIF. Voor foto's uit de oude doos zeer handig. Je kan op die manier bijvoorbeeld de gegevens van je foto's op je pc, op flickr.com en op iNaturalist met enkele klikken voortdurend synchroniseren.
2.4) Je kunt grotere fotos kwijt met meer detail..8MP.
2.5) Crowd validatie kent ook wel zijn beperkingen en een peer review zou niet zo erg zijn. Maar een reputatieschema, daar wil men niet aan..zou je dan penalties moeten geven ?

3. Rinat Packe in 'R'

Ik gebruik het rinat package in R (zie bv. https://ropensci.org/blog/blog/2014/03/26/rinat). Die maakt direct gebruik van hun API. Vanuit R kun je alles ermee doen, ook zo nodig wegschrijven naar andere formaten.

4. Winnaar is iNaturalist

Met afstand de winnaar van onze test is de iNaturalist. Naast functionaliteiten als het determineren van bomen en planten, is iNaturalist een platform voor burgerwetenschappers en dat is iedereen die een bijdrage levert aan de databank. Alle observaties van de zeldzaamste vlinder tot het meest algemene onkruid worden ingetekend op de digitale wereldkaart, die al ruim 28 miljoen observaties bevat. De iNaturalist is zo een wereldwijd platform waar natuurliefhebbers elkaar ontmoeten. Voor iedere deelnemer is er een eigen pagina met een dagboekfunctie en er zijn verschillende fora waar de deelnemers van gedachten wisselen en projecten starten. Zo wordt er gewerkt aan een wereldwijde veldgids voor de stadsnatuur.
Ook Amsterdam is rijk vertegenwoordigd met hond

5. Mix-n-match.toolforge.org

https://mix-n-match.toolforge.org/#/catalog/3900
It’s so much fun to explore iNat via Wikidata: https://w.wiki/37Sx
Open Refine. Zie: https://w.wiki/37MB

Your observations: MAP(left button)
https://www.inaturalist.org/observations?place_id=any&user_id=ahospers&verifiable=any
Estimated distribuiton of the data(takes some time to load)
https://observation.org/user/area_stats/1058?groep=0&sex=0&z=0&from=2003-08-19&to=2018-08-19&maand=0&jaar=0&seasons=0&exo_not=0&exo_only=0&sure=1&prov=0&only_areas=0&foto=0&sound=0&validatie=B
Distribution of species
https://www.inaturalist.org/observations?place_id=any&subview=grid&user_id=ahospers&verifiable=any&view=species
Identifications
https://www.inaturalist.org/identifications?place_id=any&subview=grid&user_id=ahospers&verifiable=any
The import started at 17 augustus 2018 om 04:11
August 19, 2018 01:11AM CEST
The import stopped at August 19, 2018 10:33 AM CEST

6. iPhone iCloud FotoKiezer

Er is als ik het goed begrepen heb -- een nieuwe native fotokiezer in iOS 14 die onder andere een zoekveld ondersteund tijdens het selecteren van foto's uit de fotogalerij. Ook zijn de prestaties beter bij het laden/browsen van albums in iCloud. Daarnaast is er ook ondersteuning voor het bladeren van BESTANDEN ipv allen de FOTOKIEZER, op die manier kunnen ook bestanden uit een map geladen worden ipv alleen uit de fotogalerij.
https://forum.waarneming.nl/index.php/topic,475127.0.html
Ik ervaar hinderlijk slechte prestaties van de huidige fotokiezer in ObsIdentify (met een iPhone XR), zoals ik hier heb gemeld (maar geen reactie op heb ontvangen).
Ik neig er daarom naar om de website te gebruiken, maar die is dan regelmatig weer niet in staat om GPS gegevens aan de foto's te ontfutselen, terwijl ObsIdentify dat met dezelfde foto's wel lukt.
https://forum.waarneming.nl/index.php/topic,475127.0.html

7. Index Opbouw Inhoud

https://www.inaturalist.org/stats/2019/
https://www.inaturalist.org/stats/2019/ahospers
https://www.inaturalist.org/observations/compare
https://mapsandapps.github.io/inat-streak/
https://www.inaturalist.org/stats/2019.json Is zon json niet inefficient
https://www.inaturalist.org/stats/2018/ahospers
https://www.inaturalist.org/stats/2017/ahospers
https://www.inaturalist.org/stats/2016/ahospers (Seems only verifyable are used)

https://forum.inaturalist.org/t/what-are-your-favorite-projects-and-which-should-i-join/2212/3?u=ahospers

OK, here is how you can see your options: In the Community ID box, click "compare", then set the Place to "South America", and for Taxon, type in Calycopis, you'll get: these 4 matches in that genus: C.origo, C.isobeon, C.caulonia, C.cerata. But then try "Lycaenidae" (the larger family), and you'll get Ministrymon azia, and Strymon melinus added to that list of 6 very similar species. You may need a more local expert.
https://www.inaturalist.org/observations/identotron?observation_id=9344400&taxon=47157#establishment_means=&order=&place=97389&taxon=47923

https://forum.inaturalist.org/t/how-to-use-inaturalists-search-urls-wiki/63
My Unknowns
https://www.inaturalist.org/observations?iconic_taxa=unknown&page=28&place_id=any&reviewed=any&subview=grid&user_id=ahospers&verifiable=any
My Unknowns
Je kunt ze ook vinden door naar "your observations" te gaan en dan bij filters de "unknown" filter aan te zetten. Dan zie je alles waar geen soort naam bij staa
https://www.inaturalist.org/observations?iconic_taxa=unknown&user_id=ahospers
UNKNOWN SouthAfrica TonyReblo (why page4?)
https://www.inaturalist.org/observations?iconic_taxa=unknown&page=4&place_id=113055&reviewed=any&subview=grid&user_id=ahospers&verifiable=any

==
It is possible using the unobserved_by_user_Id parameter in the observations view.

2 caveats

if you do a species view, you are restricted to the 500 most frequently seen species unless you start filtering down (ie add birds or beetles etc)
the ‘unseen’ is not geographic specific, it counts you as having seen it if you have seen it, but not in the location you specify.(so for example in the list below, Grey Kingbird will not appear, even though I have never observed one in Ontario, just elsewhere)
For excample this url shows all the birds reported from Ontario that I personally have not seen (or more accurately not recorded an iNat record for as I have actually seen some of them)

https://www.inaturalist.org/observations?place_id=7506&subview=table&taxon_id=3&unobserved_by_user_id=ahospers&view=species9

you can add additional filters for hrank and lrank equals species if you want to get rid of the genus level records.

all these Check Rep observations have been placed (wrongly) in Amurskiy rayon, KH, RU https://www.inaturalist.org/observations/identify?quality_grade=needs_id%2Cresearch%2Ccasual&user_id=ahospers&place_id=42066&captive=false

But it would also be helpful, for example, if you know a particular person is an expert in a taxon. If you could find observations they've added IDs to, There's also this somewhat hidden endpoint where you can search
Identifications by taxon and user e.g.:
https://www.inaturalist.org/identifications?taxon_id=171769&user_id=loarie
Try "ident_user_id"
https://www.inaturalist.org/identifications?ident_user_id=loarie
I find it very easy and quick to annotate my observations in the Identify tool right after I upload them, now that I’ve gotten into the habit. I’ve bookmarked https://www.inaturalist.org/observations/identify?reviewed=true&quality_grade=needs_id%2Cresearch&user_id=tiwane and this shows me all of my own observations I’ve reviewed (ie observations to which I’ve added an ID), with the latest ones first. Then it’s just a matter or going through them. That URL should work for anyone, just replace “tiwane” with your own username.

Find observations missing a location
https://www.inaturalist.org/observations?quality_grade=any&place_id=any&not_in_place=91708,97391&user_id=ahospers&verifiable=any works!
https://www.inaturalist.org/trips
https://www.inaturalist.org/atlases
https://www.inaturalist.org/flags
https://www.inaturalist.org/guides
https://www.inaturalist.org/places

https://inaturalist.github.io/growths.html?name=nld
https://inaturalist.github.io/growths.html?name=nor
https://inaturalist.github.io/growths.html?name=swe
https://inaturalist.github.io/growths.html?name=tha

SEARCH own Identifications
https://www.inaturalist.org/identifications?user_id=juliereid 3

Other parameters you can add:

&taxon_id=1234
&category=maverick|supporting|improving|leading Default: any
&current=false|any Default: true
&for=self|others|any Default: any

Projects with fields
https://www.inaturalist.org/projects/jos-animaux-2018
https://www.inaturalist.org/projects/jos-plantes-2018
https://www.inaturalist.org/projects/leaf-and-plant-galls
https://www.inaturalist.org/blog/15450-announcing-changes-to-projects-on-inaturalist
But there is still a huge need for classical projects: i.e. projects to which observations are manually added, or added by virtue of observation fields that are required. To my mind these are "tagged" projects. (in iNat logic one traditionally "added observations to projects", but for similar projects on iSpot we added tags and created projects to filter on the tags - the net effect is the same, a lookup table of project-tag and observation, that can be used as a filter - either alone or with other filters).
The addition of a project-tag filter to the new projects will make the "traditional" projects into "collection type" projects too, while preserving the Project Icons on the observations.
((the additional functionality of defining observation fields from within a project is an extremely useful feature.))

No coordinates and you have other obs from the same day and all those obs from that day HAVE TIMES appending ?interpolate_coordinates=true to the edit observation URL (the URL you’re at when you’re editing an obs, e.g. https://www.inaturlaist.org/observations/edit?interpolate_coordinates=true) will fill in coordinates based on a time-weighted average of the nearest observations in time.

A nitpick: is the central filter a Location filter (using google places) or a Place filter (using user-created iNat polygons) or both? It would help if the terminology was standardized with the observations pages and its filters.

link for creating a traditional project: https://www.inaturalist.org/projects/new_traditional

https://forum.inaturalist.org/t/using-the-field-similar-observation-set-for-linking-observations-of-lepidoptera-when-raising-on/1018 E.g., “Similar Observation Set 5,” or “Linked Observation” work well for this. And yes, you’ll definitely want to make new observations for this.

https://forum.inaturalist.org/t/good-cameras-for-nature-shots/1064

https://calnature.org/blog/2016/8/18/cell-phone-macrophotography-insects

NO LOCATIONS
NO COORDINATES
for this user, filtering on verifiable=false gives me more or less what I want, but conflates these with any Data Quality criteria, not just missing coordinates.
https://www.inaturalist.org/observations?place_id=any&subview=grid&user_id=ahospers&verifiable=false 1

This is slightly better as it’ll exclude captive=true and species = human:

https://www.inaturalist.org/observations/identify?quality_grade=casual&captive=false&photos=true&order_by=random&without_taxon_id=43584&user_id=dineo_dibakwane

This comes from Ways to help out on iNat - wiki:
“Help fix casual grade observations 1 by informing the observer that the date or location is missing”
https://www.inaturalist.org/observations/identify?quality_grade=casual&order_by=random&captive=false&photos=true&without_taxon_id=43584&user_id=18823&place_id=any

https://forum.inaturalist.org/t/how-to-use-inaturalists-search-urls-wiki/63/190

ave you tried using this link? https://www.inaturalist.org/projects/new_traditional 4

https://www.inaturalist.org/observations/compare

https://www.wikiuploaderapp.com/features.html
https://download.cnet.com/Wiki-Uploader/3000-20418_4-78600545.html

This will only partially answer your questions, but to see your maverick IDs (3 or more disagree with your ID): https://www.inaturalist.org/identifications?user_id=sarah1101&category=maverick 31
And to see your percentages of leading, supporting, and improving IDs:
https://www.inaturalist.org/identifications?user_id=sarah1101

5. Oud vs New wrn.nl

Ik plaats af en toe wat op het forum maar dat wordt meestal niet zo positief ontvangen


  • **Het bevreemdt mij dat de nieuwe site door kenners en waarnemers met ervaring zou zijn geprogrammeerd. Dat blijkt nergens uit. Het programmmeer gemak en de performance van het systeem aren leidend.
  • Ik zie bij ObsMapp 9 ook weer zo'n drama; bij alle vorige versies werd het wiel opnieuw uitgevonden en nu ook weer...
  • De logica van de oude site was terecht, dat een externe link extern is en dus geen onderdeel van de waarneming beschrijving

  • Soortenlijsten mis ik bv enorm, mocht ik op de ouwe graag gebruiken.
    De nieuwe site lijkt vooral gericht op data melden/verzamelen en wat ik noem spelletjes "wie heeft de langste/meeste". De ouwe was meer ook een kennisdatabase, dat lijkt steeds meer uitgekleed te worden.
    /rantoff, ik weet primaank en de waarnemingen gaan ook steeds vaker niet online. Digitaal is/was het toch best een stukje handiger maar dat lijkt nergens positief te ontwikkelen; versplintert, verhardt en verkaalt voor

  • View All